サプリメントのボトルが変色しました。今までに変色した事例はありますか？

ボトル変色の可能性はあります。
ボトル（プラスティック製）は日光や蛍光灯による光の影響を受けるため、白色からクリーム色に変色する可能性があります。
保存する場合、日光や蛍光灯の光が当たらない棚などに保管していただく事がお勧めです。